A escrita era incorreta.
A forma como você escreveu o terminal do big até tentou interpretar para lhe ajudar para ele atualizou o pacote flatpak.
O correto seria , neste caso sudo pacman -Syu flatpak (Para atualizar o pacote flatpak , o gerenciador para flathub no caso)
O que você esta precisando é atualizar os pacotes que “entre aspas” são dependências de aplicações flatpak , então o correto seria
flatpak update , traduzindo para linguagem pobre seria >> flatpak atualize seus pacotes
Se quiser, estou colocar um grande SI, instalar o Baazar, e a loja de gerenciamento de pacotes apenas de flatpak do Bazzite, a aparência dele e muito boa e também e bem funcional, mas , se não faz uso de pacotes flatpak então melhor mesmo seria remover por completo todos.
o comando seria ``flatpak uninstall –all``` [ Agora cuidado pois esse remove todos os pacotes em flatpak use com sabedoria]
