Estou com o mesmo problema.
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BigLinux, após ser inicializado, (1) se ficar ligado apenas por cerca de uma hora, ao se comandar o desligamento (shutdown) pela Central de Controle, desliga muito rapidamente, em cerca de dois a três segundos; contudo (2) se ficar ligado por algumas horas (não cheguei a testar o limite até a falha), nessa hipótese ele não desliga de forma alguma, sendo necessário pressionar o botão liga-desliga e segurá-lo até o completo desligamento.
A recomendação via terminal pode ser que funcione, mas não posso deixar de observar que, para um projeto tão excelente como é o BigLinux, a opção gráfica para o desligamento não pode falhar em hipótese alguma.
Agradeço e aguardo as boas providências da equipe.