Descobri, para apagar a partição GPT, no terminal tem que utilizar estes comandos:
sudo parted /dev/sdX onde X é a letra do disco
msdos para responder a pergunta e em seguida yes pra confirmar.
O problema é a partição GPT levou junto a MBR, hahaha, ou seja, o disco foi formatado. Como imaginei que isso pudesse acontecer, já havia instalado o Big no SSD novo e copiado todos os arquivos, o chato é instalar todos os programas de novo, logar etc., mas tá bom, pelo menos agora no novo disco a tabela GPT está correta.
